سیستم ژنتیکی و پتانسیل¬های بالقوه آن در اصلاح نژاد دام

سیستم ژنتیکی و پتانسیل­های بالقوه آن در اصلاح نژاد دام

 

نوشته شده توسط:
محمد قادرزاده، دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دام، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

[e-mail]

 لطفاً ادامه مطلب را ببینید

 

دسترسی آسان و رایگان به مقالات علمی و کتابهای لاتین

برای دسترسی آسان و رایگان به مقالات علمی در حوزه های مختلف علمی و همچنین دانلود رایگان فایل کتاب های علمی به زبان اصلی می توانید به پایگاه زیر مراجعه کنید. جدیدترین و به روز ترین منابع در این پایگاه قابل دسترسی هستند. برای ورود به این پایگاه روی لینک زیر کلیک کنید:

Library Genesis

آموزش تصویری طراحی پرایمر بوسیله Primer3

در این پست نحوه طراحی پرایمر مورد نیاز برای واکنش زنجیره ای پلیمراز به وسیله نرم افزار Primer3 در قالب فایل تصویری خدمتتان ارائه می شود. برای دریافت و یا مشاهده فایل تصویری روی لینک زیر کلیک کنید:

دستورات پرکاربرد لینوکس در بیوانفورماتیک

لینوکس، یک سیستم عامل پرکاربرد در زمینه های بیوانفورماتیک و تجزیه و تحلیل داده های ژنومی و داده های ژنتیکی با حجم بالا است. یکی از محدودیت های استفاده از این سیستم عامل برای کسانی که دانش برنامه نویسی کافی ندارند، نیاز به استفاده از دستورات (Commands) جهت اجرای عملیات های مختلف است. بنابراین تعدادی از دستورات پرکاربرد در این پست خدمت شما ارائه می شود. برای دریافت لینک زیر را انتخاب کنید:

انتشار شماره جدید نشریه بخش علوم دامی دانشگاه شهید باهنر کرمان

شماره جدید نشریه

 Journal of Livestock Science and Technologies  

در تاریخ 5 می 2016 منتشر شد(جلد 4، شماره1):

http://lst.uk.ac.ir/

این نشریه علمی-پژوهشی توسط دانشگاه شهید باهنر کرمان و انجمن علوم دامی ایران هر شش ماه یک بار و به زبان انگلیسی منتشر می شود.

کروموزوم Y

منشاء کروموزوم های جنسی

طبق نظریات مختلف، در طول 240 تا 320 میلیون سال تکامل پستانداران، دو کروموزوم جنسی از یک جفت اتوزوم تکامل پیدا کرده است. در طول این تکامل بیشتر ژنهای اجدادی از بین رفته اند که بدلیل کمبود نوترکیبی میوزی میان این دو کروموزوم در حال تکامل بوده است. ژنهای کنترل کنندۀ اسپرماتوژنز از دیگر کروموزوم های اتوزوم به Y  انتقال پیدا کرده اند. چنین ژنهایی در اکثر موارد بعد از انتقال تکثیر شده اند و کپی های مختلفی از آنها تشکیل خانواده ژنی داده اند. به نظر می رسد که در ابتدا وجود یک فاکتور تعیین جنسیت روی این کروموزوم باعث ادامۀ تغییرات شده است. ادامه مطلب را ببینید 

شبکه عصبی مصنوعی

یک شبکه عصبی مصنوعی  (Artificial Neural Network (ANN))ایده ای برای پردازش اطلاعات است که از سیستم عصبی زیستی الهام گرفته شده و مانند مغز به پردازش اطلاعات می پردازد. عنصر کلیدی این ایده، ساختار جدید سیستم پردازش اطلاعات است. این سیستم از شمار زیادی عناصر پردازشی فوق العاده بهم پیوسته تشکیل شده  (neurons)که برای حل یک مسأله با هم هماهنگ عمل می کند، و قادر به انجام انبوهی از محاسبات موازی جهت پردازش داده ها می باشد. ادامه مطلب را ببینید 

آشنایی با چند پایگاه مهم در بیوانفورماتیک

در این پست قصد داریم شما رو با چند تا از مهمترین پایگاه های مربوط به بیوانفورماتیک آشنا کنیم. برای دریافت فایل مربوطه، روی لینک زیر کلیک کنید:

نواحی ژنومی تحت انتخاب یا نشانه های انتخاب (Signatures of Selection)

هر تئوری که هدف آن رد کردن مدل تکامل خنثی باشد را تئوری خنثی گویند. بر اساس این تئوری اکثر جهش­ های سطح ژنوم خنثی هستند و اثرات مضری بر روی شایستگی ژنتیکی افراد دارند. چنانچه یک جهش جدید باعث افزایش شایستگی افراد حامل آن نسبت به سایر افراد جامعه گردد، انتخاب باعث می­شود افرادی که دارای شایستگی بیشتری هستند در تشکیل نسل بعد مشارکت بیشتری داشته باشند. بدین ترتیب فراوانی واریانت جهش یافته بسته به سهم آن در افزایش شایستگی به سرعت شروع به افزایش خواهد کرد. به عبارتی، هنگامی که انتخاب مثبت به سمت افزایش فراوانی آلل مطلوب پیش می­رود، جایگاه­های نزدیک به این جایگاه اگر هم اثرشان خنثی باشد به علت پیوسته بودن با آلل مطلوب فراوانی­شان زیاد شده که در نتیجه این پدیده، الگوی تنوع ژنتیکی و عدم تعادل لینکاژی در جایگاه­های اطراف این جهش انتخابی تغییر خواهد کرد. در ژنتیک جمعیت به این نواحی، نواحی تحت انتخاب (Signatures of Selection) یا جاروی انتخاب (Selective Sweep ) گفته می­شود.

تاکنون چندین روش برای شناسایی نشانه­ های انتخاب با استفاده از داده­ های مقایسه ژنومی گزارش گردیده است. این روشها که بر اساس LD عمل می­کنند شامل آزمون هاپلوتیپ با طول بلند (LRH)، هموزیگوسیتی هاپلوتیپ گسترش یافته (EHH)، انتگرال­گیری هموزیگوسیتی هاپلوتیپ (iHS)، افت LD (LLD) و آماره F_ST (بررسی سطح تمایز زیرجمعیتی) می­باشند. این روشها در انسان و برخی حیوانات اهلی جهت یافتن چندین ناحیه مفید تحت انتخاب مانند ژنهای مقاومت به مالاریا، ژنهای مرتبط با تولید شیر و ژنهای مرتبط با رنگ پوشش بدن موفق عمل نموده­اند. استفاده از این روشها برای شناسایی نشانه­های انتخاب می­تواند ما را در تشخیص صفات تحت انتخاب، ژنهای موثر بر صفات کمی و کیفی و یا جمعیتی که QTL در آن در حال تفرق است، یاری دهند. به طور کلی، مناطقی از ژنوم که تحت انتخاب هستند بایستی اهمیت شایستگی و عملکردی داشته باشند، در غیر اینصورت انتخاب مثبت آنها را تحت تاثیر قرار نمی­دهد.

 

تجزیه و تحلیل مولفه ­های اصلی (Principal Component Analysis)

تکنیک آماری تجزیه و تحلیل مولفه های اصلی (PCA)، روشی آماری است که غالبا برای بررسی گروهی از متغیرهای همبسته بکار می رود. مهم ترین کاربردهای این روش را می توان در تجزیه و تحلیل نماگرهای چندگانه، اندازه گیری و شناخت ساختارهای پیچیده، شاخص سازی و کاهش ابعاد داده ها جستجو نمود. ادامه مطلب را ببینید...